Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms