Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPTQ96BT3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms