Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms