Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms