Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms