Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GCN1Q92616 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCN1Q92616 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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GCN1Q92616 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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