Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113Q902F9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms