Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms