Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RB1CC1Q8TDY2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RB1CC1Q8TDY2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RB1CC1Q8TDY2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RB1CC1Q8TDY2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RB1CC1Q8TDY2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RB1CC1Q8TDY2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms