Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNERQ8NFT8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms