Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms