Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD1Q8NA66 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms