Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms