Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms