Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms