Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAD11Q709F0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAD11Q709F0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms