Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms