Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms