Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7IPQ6VMQ6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms