Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms