Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC9A4Q6AI14 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms