Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L3Q68CJ9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms