Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF6Q5VXH4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms