Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms