Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms