Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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