Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms