Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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