Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P3H1Q32P28 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P3H1Q32P28 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms