Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms