Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RTL8BQ17RB0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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