Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
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