Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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ZNF239Q16600 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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