Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PCSK7Q16549 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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