Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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