Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITSN1Q15811 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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