Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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