Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms