Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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