Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms