Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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