Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIXQ14938 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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