Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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