Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms