Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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