Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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