Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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