Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM29Q14134 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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