Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms