Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PKP1Q13835 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PKP1Q13835 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PKP1Q13835 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PKP1Q13835 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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